Ярославский музей-заповедник ведет начало от музеев научных обществ Ярославля. Датой основания считается 25 января 1865 года, когда состоялось публичное открытие музея Общества для исследования Ярославской губернии в естественно-историческом отношении. В состав музея-заповедника в Ярославле входит ансамбль бывшего Спасо-Преображенского монастыря — архиерейского дома (основан в XIII веке), а также выдающиеся памятники ярославской архитектуры и живописи XVII века — церкви Ильи Пророка, Иоанна Златоуста, Иоанна Предтечи, Николы Надеина, Рождества Христова, Богоявления.
В составе музея-заповедника находятся: Мемориальный дом-музей Леонида Собинова, Музей Боевой славы, Музей «Космос» (на родине первой женщины-космонавта Валентины Терешковой — в поселке Никульское Тутаевского района). На территории бывшего Спасского монастыря расположены основные экспозиции музея-заповедника: естественно-историческая, историческая, сокровищница Ярославля, а также уникальная экспозиция «Слово о полку Игореве — выдающийся памятник древнерусской культуры».