Здание, в котором сегодня размещается музей, — главный дом одной из ростовских купеческих усадеб, сформировавшейся в конце XVIII — начале XX века. С 1835 по 1917 год усадьба находилась во владении поколений купцов Кекиных — видных представителей местного купечества, чья деятельность оказала заметное влияние на экономическое и общественное развитие города. После национализации в 1918 году дом был передан под сельскохозяйственный техникум.
В 1999 году главное здание усадьбы обрело культурное предназначение — оно было передано музею. После масштабной реставрации, завершенной в 2008 году, здесь открылся Музей ростовского купечества.
В комнатах дома размещена экспозиция «Кекины — род, судьба, наследие», посвященная истории семьи Кекиных и — через ее призму– становлению и жизни ростовского купечества в целом. Посетители знакомятся с генеалогией местных купеческих династий, укладом их жизни, торговой и благотворительной деятельностью, а также духовными и материальными основами их культуры. Здесь воссозданы интерьеры типичных комнат купеческого дома конца XIX — начала XX века: гостиная, будуар, столовая и кабинет.
Помимо постоянной экспозиции в части залов музея регулярно проходят временные выставки. В реставрационной мастерской для посетителей организуются мастер-классы по восстановлению бумажных документов — возможность прикоснуться к подлинной музейной практике и ощутить связь с историческим наследием.
