История развития Бавлинского краеведческого музея берёт начало с января 1986 года. Музей был открыт на основании постановления бюро Бавлинского РК КПСС «О создании Бавлинского районного краеведческого музея».
Инициатором создания музея был секретарь РК КПСС А.М. Рахманкулов. До 1990 года музей существовал на общественных началах. Большую работу по сбору экспонатов для музея провела первый директор музея Р.М. Нурисламова.
До 1996 года музей работал в режиме сменных экспозиций. С 1996 года при музее открывается первая экспозиция «Бавлы — мой край родной», которая является в настоящее время главной и рассказывает посетителям историю города и района с древнейших времён до современности. В 1997 году открывается экспозиция «Отдел природы», в которой представлена местная флора и фауна.
Основной фонд музея на 1 января 2026 года составил — 12242 единиц хранения,
научно-вспомогательный — 6130.