Музей открыт в 1985 году. В небольших залах деревянного дома, построенного в конце XIX века, представлены экспонаты и материалы, отражающие историю нагайбаков и Нагайбакского района, а так же их культуру.
В первом зале оформлен тематический уголок в виде рабочего стола первого директора, основателя музея — Алексея Михайловича Маметьева. Здесь хранятся его личные вещи, научные труды, рукописи. В этом же зале посетители могут получить информацию о природных и археологических памятниках района. Здесь же представлены временные, тематические экспозиции и выставки.
Второй зал рассказывает об истории переселения и истории казачества. Представлена экспозиция об участии жителей Нагайбакского района в Великой Отечественной войне: размещены фотографии участников войны, фронтовые письма, ордена и медали, личные вещи. Отдельные экспозиции расскажут о героях войны, тружениках тыла. Экспозиция «Воинский долг» повествует о воинах-интернационалистах района.
В третьем зале оформлена инсталляция интерьера казачьей избы. Представлены основные предметы быта и хозяйства, орудия труда, образцы народного нагайбакского костюма.