Краеведческий музей открыт к 100-летию образования поселка Вожега. В связи со строительством железной дороги Вологда — Архангельск на карте Вологодской губернии в 1895 году появилась небольшая рядовая станция.
Современная выставочная деятельность музея представлена двумя постоянными экспозициями: «Промыслы и ремесла Вожегодского края» и «Церковное искусство края». Музей организует ежегодные тематические передвижные выставки к мероприятиям. Особый интерес у жителей Вожегодского муниципального округа и гостей вызывают выставки местных самодеятельных художников.
Основными направлениями деятельности музея являются организация нравственно-воспитательной и образовательной работы, сохранение народной культуры, патриотическое воспитание. В деятельности используются различные формы работы: экскурсии по выставкам, беседы, лекции, музейные уроки, мастер-классы, викторины, конкурсы.