Музей находится в одноэтажном деревянном здании. В 1994 году здание начальной школы перевезли из деревни Лощинской Мишутинского поселения Вожегодского района в Вожегу и переоборудовали под краеведческий музей. Торжественное открытие музея состоялось 6 августа 1995 года к 100-летию посёлка Вожега.
Музей был создан на основе коллекции краеведческой комнаты районной библиотеки, собираемой на протяжении 5-6 лет на территории района. Большую её часть составляли предметы крестьянского быта, орудия труда конца XIX-начала XX веков. Первая коллекция насчитывала чуть более 500 музейных предметов. С открытия музея началось регулярное пополнение музейных фондов за счёт исследовательских экспедиций. В настоящее время фонд музея насчитывает свыше 5 тыс. единиц хранения. В его основе находятся следующие коллекции: дерево, металл, ткани, керамика, стекло, грампластинки, нумизматика, фотографии и документы, изобразительные источники.
Современная выставочная деятельность музея представлена двумя постоянными экспозициями: «Промыслы и ремесла Вожегодского края» и «Война. Победа. Память», которая состоит из 3 частей: «Железная дорога в истории края», «Славные сыны отечества» и «Время выбрало нас» (СВО). В выставочном зале оформляются тематические выставки, которые меняются раз в месяц.