Байкальский музей имени профессора М.М. Кожова имеет статус вузовского музея, входит в состав кафедры гидробиологии и зоологии беспозвоночных биолого-почвенного факультета ИГУ. Музей создавался несколькими поколениями ученых и студентов биолого-почвенного факультета. 

Его судьба неразрывно связана с именами Бориса Сварчевского — первого заведующего кафедрой зоологии беспозвоночных, и Михаила Кожова — известного байкаловеда. В экспозиции представлены различные группы байкальских животных и растений (водоросли, губки, черви, моллюски, ракообразные, насекомые, рыбы, нерпа). А также коллекция морских, пресноводных и наземных беспозвоночных мировой фауны, коллекция насекомых, главным образом Прибайкалья.

В музее выставлена коллекция картин известного сибирского художника Б.И. Лебединского. Имеется мемориальная комната проф. М.М. Кожова, энтомологический кабинет. Основной фонд музея составляет более 8000 единиц хранения, в экспозицию введено 2500 единиц хранения. Научно-вспомогательный фонд — более 5000 единиц хранения.